Alltså, det beror ju lite på vilken drivrutin för kommunikation mot databasen du använder, inte bara var databasen är fysiskt placerad eller vilket (fil)system denna lokation kör, för det är oftast irrelevant.
Med andra ord, kan du inte få stöd för att kommunicera med Access-databasen i Linux (i Windows använder man lämpligtvis ODBC eller OLEDB, helst det sistnämnda) så får du nog fundera på ett databas-byte, alltså migrering till t.ex. MySQL eller någon annan databas som du kan kommunicera med från Linux-plattformen.
Huruvida ODBC finns till Linux (OLEDB kan jag aldrig tänka existerar på *nix) har jag inte den blekaste aning om, men det går väl ganska lätt att ta reda på? Kanske finns det ett supplement som fungerar liknande?
I vilket fall som helst; det hjälper inte bara att flytta databasen eftersom kommunikationen ligger kvar på applikationsnivå, dvs. på webbservern (linux).