Även om du lägger in källkod som includes, så levereras sidan komplett till användaren. Det är alltså inte "mindre att ladda" (ska man vara petig, så tar det t.o.m. bråkdelen av en sekund längre att ladda eftersom servern ska hämta och inkludera din include innan hela konkarongen skickas till användaren).
Största fördelen med includes är att det räcker med att ändra i en enda fil för att ändringen ska slå igenom i alla andra filer som länkar in den. Typiska användningsområden för includes är headers, menyer, footers, banners osv.
Men visst är det ibland en fördel att slippa en massa onödig kod! Jag har själv gjort så för att minimera risken för misstag ibland, och särskilt när kunden själv ska in och peta i källkoden då och då. Genom att köra med includes till så mycket som möjligt (även allt från <head> till <body>) så blir det i stort sett bara själva innehållet som han kan dona med.
Brukar köra principen att funktioner som skall användas på flera sidor läggs i en fil som jag sedan inkluderar.
Det är inte en funktion per fil utan jag brukar gruppera dom på ett lämpligt sätt (vad dom gör, används dom ihop ...).
Sedan är det som Danne V skriver, man förlorar lite prestanda men man kommer inte att märka av det, det är annat som tar tid (ex. hämta info från databas) och det blir inte mindre antal rader för php tolken att hantera utan snarare fler eftersom den minst måste hantera include/require raden.
