Själva sökvägen fixar du när du inkluderar filer där funktionen ligger. Nu förstår jag inte riktigt hur filerna ligger i förhållande till varandra så mina sökvägar är nog alldeles galna.
Du kan inkludera relativt:
include "mapp1/mapp2/funktions.php";
// Eller
include "../../funktions.php";
Du kan också inkludera med absolut sökväg. DOCUMENT_ROOT ger dig webbroten
include $_SERVER['DOCUMENT_ROOT']."/mapp/funktions.php";