Det beror inte på MySQL utan på vad du hämtar in datan med. Det är standard att konstiga tecken kodas på det viset när man skickar formulär med kodningstypen application/x-www-form-urlencoded, vilket är defaulttypen för vanliga HTML-formulär. Det blir likadant oavsett om man använder GET eller POST, däremot ser det annorlunda ut om du använder exempelvis multipart/form-data (som används för filuppladdningar).
Men, för att göra en lång historia kort, det spelar ingen roll.