Ta med dig datorn som handbagage, det gör alltid jag, då är man säker på att den klarar sig och till på köpet kan man lira tetris för att förkorta långa tråkiga flygningar.
Ska man vara petig så får du inte skicka datorn med det vanliga bagaget eftersom datorer klassas som "otillåten elektornik" i det fallet. Inte med mindre än att incheckningspersonalen informeras och ger sitt godkännande.
Jag flyger jämt med min dator och jag har med den som handbagage. Jag skulle nog också ha med mig hårddisken in i kabinen, inte för att det har med lufttryck att göra utan för stötarna som kan ställa till det. Hade själv en liten extern hårddisk (firewire) som jag slängde in i mitt vanliga bagage och den skadades, trots att jag lindat in den väl osv.
Om du är orolig för temperaturskillnader så låt datorn sitta i den temperatur du sen ska vistas i i några timmar så att den får ställa in sig (dvs så den inte är för kall, och det blir kondens, osv). Ska inte vara några problem det heller.