Lite olika beroende på plattform men om vi antar att du har windows.
Skapa en textfil och skriv in (med din konfiguration)
@[i]C:\[/i][b]mysql\bin\mysqldump.exe -h localhost -u[/b] [i]användarnamn[/i] [b]-p[/b][i]lösenord databasnamn[/i] > [i]E:\backup\mysql_dump.sql[/i]
och döp den till exempelvis mysql_backup.cmd
Sedan kör du filen när du vill med den inbyggda schemaläggaren.
I Linux är det i stort sett samma procedur
mysqldump -h localhost -u [i]användarnamn[/i] -p[i]lösenord[/i] databasnamn > /home/backup/mysql_dump.sql
men se till att chmodda så den blir exekverbar och kör sedan med crontab