Safe mode borde inte ha någon betydelse för det.
Det finns ett bra exempel i manualen hur du gör: http://se2.php.net/manual/en/function.readdir.php
Kolla in Example 2.
Trådstart#1
Nån som vet om det går och hur man gör om man behöver lista en innehållet i en mapp när Safe Mode är påslaget?