Du kan använda klasser i PHP, det är visserligen inte helt ut objektorienterat men kan hjälpa dig att få en smidigare kod. Lägg logiken i klasser och stoppa dessa i separata filer som du importerar på sidorna som skall använda klassmetoderna.
Försök att separera kod och design så mycket som möjligt, istället för att köra en loop som itererar igenom ett resultat från en databasfråga i själva "design-sidan" så anropar du en metod i en separat klass som spottar ut det du vill ha, på så sätt blir sidorna mer överskådliga.