Du har inget \ för slutcitatet (eller vad man ska kalla det?) på href och du har inget i slutcitat på onClick alls.
Kan det vara därför?
echo "<a href=\"#\" onClick=\"window.open('index.php', 'nytt_foenster')\">[Admin]</a>;
Frågan#1
Varför fungerar inte detta?
echo "<a href=\"#" onClick=\"window.open('index.php', 'nytt_foenster')>[Admin]</a>;