Själv använder jag Sendmail som mailserver i de system jag konfigurerat (Slackware, Debian och FreeBSD). Sendmail är kompatiblet med i sort sett alla Unix distrubition och har för mig fungerat utan direkta problem.
När det gäller webbmail så bör du ju använda IMAP för "nerladdning" utav posten, m.a.o. posten ligger på en central mailserver. Det finns ett antal grafiska interface skriva i php/asp. Ett tips är SquirrelMail.