Förmodar att du menar att radbrytningarna ställer till problem (\n i Unix, \r\n i Windows)? I så fall kan du göra som jag brukar. Öppna filen som du vill "konvertera" i pico, skriv ett mellanslag, ta bort det du skrev (ett mellanslag t.ex), spara filen (^O), avsluta (^X) och voila Annars borde det vara relativt enkelt att skriva ett script som gör det istället...
(ASCII är väl samma på varje platform: American Standard Code of Information Interchange?)