Google vet! Första (och troligen andra osv också) svaret löser ditt problem.
http://www.google.com/search?client=opera&rls=en&q=java+file+rename&sourceid=opera&ie=utf-8&oe=utf-8
Frågan#1
Går det, och i så fall hur, att byta namn på en fil via ett vanligt Javaprogram?
