Hur dokumentera pa bästa sätt?

Jag haller pa med ett relativt simpelt Java-projekt pa högskoleniva. Kraven är inte skyhöga, sa själva kodandet är inga problem.

Däremot skulle jag vilja passa pa att lära mig hur man dokumenterar pa ett bra sätt. Vilka standarder finns det för:
- löpande kommentarer i koden;
- information om klasser/interfaces/metoder;
- en extern dokumentation, dvs ett dokument med mycket mer utförlig information än den som finns i koden?

Ge gärna exempel om ni har nagot .