För det första så tycker jag att iframes ofta kan bli onödigt krångligt när man försöker göra något enkelt. Det du försöker göra kan säkert göras enklare och bättre med "vanliga" frames. (Om jag får se koden kanske jag kan hjälpa dig med det)
Men koden du söker, om jag har förstått ditt inlägg rätt, är:
<body onload="parent.window.scrollTo(0,0);" >
(Ska placeras i sidan som öppnas inuti iframen.)