Jag skulle inte rekomendera det, även om det kanske skulle fungera rent tekniskt så blandar du två helt olika tekniker i samma projekt och det är ingen bra lösning.
Så fortsätt skriva den i webforms, eller lyft ut delar av projektet och skapa nytt projekt där du fortsätter i ASP MVC. Rent teknisk så löser du det med virtual directory / olika host processer i IIS:en sedan.
- Magnus