Prova annars att avsluta X (eller var han nu använder musen) och sedan starta det igen, kan fungera.
Antar att det är en PS/2-mus som strular, de stödjer nämligen inte in- och urkoppling när datorn är på, så som t ex USB gör. Sedan är olika moderkort mer eller mindre känsliga för detta, vilket antagligen är orsaken till att det bara strular på den ena maskinen.
Om du kopplar musen direkt till Linux-datorn och sedan kopplar ur och in den igen, händer förmodligen samma sak. För att undvika detta har vissa KVM-switchar en emuleringsfunktion som gör att alla datorer som är kopplade till den "känner av" mus och tangentbord hela tiden.